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鱼类与水生生物呼吸在线观测系统是由丹麦奥尔堡大学和哥本哈根大学研制的上、为广泛应用的水生生物特别是鱼类呼吸测量仪器，主要用于鱼类、水生无脊椎动物、鱼卵及其胚胎乃至浮游生物的耗氧量测量，同时还可以配置CO2传感器和PH计以测量CO2排放、PH值等，与摄像头和行为分析软件配合进行行为轨迹观测分析等。广泛应用于海洋淡水鱼类等水生生物生态学、水体环境毒理学、水产养殖、鱼类行为生理生态、水生动物发育生态及水族箱等研究。右下图为幼体虹鳟鱼的呼吸代谢测量，可以看出，在开始时由于处理鱼时造成的应急反应，耗氧量很高，随后即达到一个较低的平稳水平——相当于其基础代谢率。从图中还可以看出，本系统有很高的时间解析度，可以反应突然的耗氧量变化。鱼类与水生生物呼吸观测系统采用“间歇式”测量原理，集合了“开放式”（实时测量）和“封闭式”（测量简单但精度差）的优点，同时又克服了开放式测量时间解析度差、封闭式不能连续长时间测量等缺点。“间歇式”测量的呼吸室放置在水浴槽（周边水体）内，循环泵可以确保呼吸室内水体的均一并保证有足量的水体流经传感器，而水体交换泵可以使周边水体与呼吸室内水体进行交换。测量时水体交换泵关闭（呼吸室类似封闭式），然后由计算机控制开启交换泵，周边水体被泵入呼吸室从而使氧气水平达到测量前的水平。整个过程分3个步骤：测量、水体交换、等待，测量时循环泵开启，水体交换时交换泵开启循环泵关闭，等待时交换泵关闭循环泵开启，每10分钟即可测量1次。如此以来，象“开放式”一样，实验可以期地进行下去，从而进行长时间的实验分析监测。在每个测量期，由于动物的呼吸耗氧，溶解氧浓度随着测量时间的延长而降低并呈直线相关关系，动物耗氧率（每小时每公斤体重消耗的毫克氧气）等于相关曲线的斜率乘以呼吸室的静体积除以动物的体重。
系统主要包括数据采集及分析单元、O2等测量单元、水环境控制单元、呼吸室及其它配件或备选件。根据需求，有单通道、4通道、8通道及更多通道测量系统，可以同时连接多个呼吸室以测量多个动物的呼吸代谢情况。